El cementerio de San Sebastián estaba ubicado en el espacio que hoy es el Colegio El Santo (edificio de Primaria) y toda la placeta del mismo, en la parte final (parte alta) de la Calle San Sebastián. Tenía una ermita que debía de ser grande pues contenía habitaciones para pobres de solemnidad, la ermita original de San Sebastián. El resto del espacio se dedicaba a nichos para su enterramiento.
En este cementerio se enterraban las personas pertenecientes a la parroquia de Santa Quiteria.
El crecimiento del pueblo por esta zona y la creación del nuevo Cementerio (el actual), ya más alejado de la población, como disponía le legislación correspondiente a salubridad en cuanto a este asunto, produjo la clausura definitiva del cementerio de San Sebastián el 15 de Septiembre de 1870. La última persona enterrada fue la viuda de D. Manuel Chocano, Dª. Antonia Navarro.
Posteriormente se construyó el primer edificio del Colegio El Santo junto a la ermita actual, cuarenta años después aproximadamente.
